直肠炎的发病原因较多，因此治疗方法上也有所差异。如果直肠炎是因为细菌感染引起，可考虑服用敏感的抗生素，比如头孢菌素、甲硝唑、左氧氟沙星等。如果病情较重，可应用糖皮质激素，患者可口服强的松龙，同时可服用美沙拉嗪等药物。
直肠炎通常是指直肠的炎症性疾病，多是直肠粘膜出现炎症，也可在池昌粘膜下层、肌层及周围组织发生炎症，其形成的原因很多，包括细菌、病毒感染、过敏反应、肠道疾病、自身免疫缺陷等因素。
因为直肠炎的病因较多，因此临床治疗也有所不同。对于致病菌感染引起的直肠炎，多采用抗生素治疗，患者可口服头孢菌素、甲硝唑、左氧氟沙星等药物。而对于放射治疗或者其他病因引起的直肠炎，患者可口服水杨酸制剂，同时也可口服强的松龙等皮质类固醇药物。
除了西药治疗外，还可采取中医治疗，患者可经专业中医师辩证之后，根据具体病情选用合适的中药，常用的中药以健脾益气、清热除湿、活血化瘀的药物为主。此外还可进行灌肠治疗，也有着不错的治疗效果。
