枯草杆菌和双歧杆菌哪个好，并没有明确的答案。两者都可用于治疗或缓解肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀、便秘等胃肠道症状，并没有太大的差别。比较常见的活菌制剂为枯草杆菌二联活菌颗粒和双歧杆菌微生态制剂，需要注意使用方法和用药禁忌。
枯草杆菌全称枯草孢芽杆菌，它广泛存在于土壤和腐败的有机物中，能高效分泌部分蛋白及代谢产物,是一种无致病性的安全微生物。双歧杆菌是本就存在于人体肠道内的一种重要有益菌，比较常见的双歧杆菌产品包括微生态制剂以及酸奶等。
这两种微生物都具有改善肠内环境的作用，适用于肠道菌群失调引起的腹泻、胀气、便秘、消化不良等症状，在效果上并没有明显的差异，只是作用原理不同。
枯草杆菌属于好氧菌，进入人体后会迅速消耗肠道中的游离氧，从而促进有益厌氧菌生长，间接地抑制致病菌繁殖。双歧杆菌能够促进维生素的合成，其主要代谢产物为醋酸、丙酸等有机酸，不仅有助于排便，还能改善肠道功能。
不管是枯草杆菌药产品还是双歧杆菌产品，使用过程中不能与抗菌药物合用，冲泡或送服水温不宜超过四十摄氏度，以免活菌被抗生素或高温杀死，失去或减弱其原有效用。
