四联疗法主要应该首选抑酸药物、保护胃黏膜的药物、抗生素药物以及抗焦虑药物等。由于四联疗法主要是治疗慢性胃炎、急性糜烂出血性胃炎以及消化溃疡等疾病，因此常会伴有胃粘膜损伤、胃酸较多等症状，需要通过相应的药物来对其进行缓解。
1、抑酸药物
幽门螺杆菌感染很有可能会导致胃分泌系统紊乱，从而导致胃酸分泌过多。因此在治疗的药物选择上，就应该选用抑酸药物来对其进行治疗。目前临床医学上较为常见的抑酸药物有奥美拉唑肠溶片，泮托拉唑，雷贝拉唑，艾司美拉唑等，患者需要根据自身的情况来选择相应的药物服用。
2、保护胃粘膜药物
若是幽门螺杆菌感染不加紧治疗，很有可能会由于胃酸过多的原因从而损毁胃粘膜，因此为保证胃部正常工作，避免胃穿孔的情况发生，就需要患者服用胃粘膜保护药物。像是硫糖铝凝胶，磷酸铝凝胶，胶体果胶铋等药物对于胃粘膜都能够起到保护的作用。
3、抗生素
幽门螺旋杆菌还有可能会致使患者胃部出现胃炎的情况，若是患者的炎症情况较为严重，就需要患者使用抗生素来对其进行治疗，从而达到良好的抵抗炎症的效果。常见的抗生素有阿莫灵、痢特灵以及克拉霉素等。
