十二指肠囊肿癌变的可能性很小，但如果存在囊肿体积较大、增长速度异常等情况，最好能及时通过腹腔镜手术来彻底切除囊肿，以免最终出现肠梗阻、急性肠出血或穿孔等严重并发症。如果无症状患者的囊肿体积较小，一般不用做手术，注意定期随访即可。
十二指肠囊肿是一种良性囊状包块，绝大多数十二指肠囊肿都是良性的，恶变的概率非常小，患者不用过于担心，但也不能不引起重视。如果十二指肠囊肿体积较小，不易压迫邻近的组织，对十二指肠的消化作用也基本没太大的影响，可以选择保守治疗，定期复诊。
如果囊肿体积小，但是增长速度较快，或者发现时体积已经比较大了，建议采取腹腔镜治疗等措施，尽早将囊肿切除，因为体积较大的囊肿会阻塞肠腔，造成肠梗阻等并发症。如果囊肿在各种因素的作用下破裂、出血并继发感染，对人体的伤害是比较大的，在出血量较多的情况下，还有可能会发生休克。
做完囊肿切除手术后，一般预后较好。在日常生活中，患者应该遵循清淡、少油、低脂的饮食原则，多吃新鲜的蔬菜和水果，尽量避免食用生冷、油腻食品以及辛辣刺激性食物。
