肾脓肿在使用药物时，首先要明确患者感染的具体细菌，然后根据敏感试验来选择合适的抗生素进行治疗。肾脓肿常见的致病菌有金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌，通常采用氨基糖甙类、头孢菌素类、万古霉素以及阿奇霉素等抗生素进行治疗。
肾脓肿的使用药物要根据细菌的敏感试验进行，肾脓肿属于严重的尿路感染性疾病，往往见于在身体抵抗力下降后或者由于细菌的毒力较强，又存在易感因素，一般是由于血源性的感染以及尿路的逆行感染，导致肾脏的单侧或者双侧发生脓肿性病变，常见的致病菌有金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌。
在治疗方面，如果患者的脓肿比较小，在3cm以下，可以采用保守治疗，静脉使用抗生素，常用的是氨基糖甙类和头孢菌素类;考虑球菌感染，可以用万古霉素和阿奇霉素。
如果药物治疗以后，患者的治疗效果不理想，还存在局部疼痛的症状时，就需要进行外科治疗，包括穿刺引流和手术切开。穿刺引流是在超声的引导下，对于小的脓肿3-5cm可以进行引流治疗，同时配合静脉使用抗生素，当脓肿较大时可以进行切开引流。
