丙肝和乙肝的区别主要在于病原体、抗体以及预后等方面。从病原体看，丙肝病毒变异快，至今无疫苗可预防，而乙肝有疫苗;从抗体看，丙肝表面抗体不具有保护性，不能清除病毒，而乙肝表面抗体则有保护性;从预后看，慢性丙肝的治疗效果比慢性乙肝好。
1、病原体不同
虽然丙肝和乙肝都是病毒感染所致，但乙肝病毒(HBV)是一种DNA病毒，而丙肝病毒(HCV)是一种RNA病毒。在针对两种肝炎病毒的预防上存在较大差别，乙肝病毒较稳定，有疫苗可以接种预防，而丙肝病毒变异较快，亚型很多，疫苗制作困难，至今尚不能有效预防。
2、表面抗体不同
乙肝表面抗体是一种保护性的抗体，它可以和病毒的表面抗原特异性地结合，然后在与其他免疫细胞或因子的共同作用下，把病毒清除掉。单项乙肝表面抗体阳性一般表示人体获得了抵抗乙肝病毒的特异性免疫力。而丙肝表面抗体并不是一种保护性的抗体，也就是说这种抗体并不具有消除丙肝病毒的作用。因此，丙肝抗体阳性只是代表病人曾经或正在感染丙肝病毒。
3、预后不同
急性乙肝和急性丙肝的治疗效果都非常好，90%以上的患者可以获得痊愈。但慢性丙肝患者的治疗比慢性乙肝患者容易，治疗方案也比乙肝患者简单，经标准抗病毒方案治疗，有机会清除病毒获得痊愈。而慢性乙肝患者的治疗方案复杂，治疗周期长，且治疗效果不如丙肝。
